В 1869 году в с.Чернозерье организована 3-х классная церковно-приходская школа решением волостной управы.

   В 1913 году школа реорганизуется в 4-х классную церковно-приходскую школу.

   В 1918 году создается начальная кустовая школа по приказу наркома образования Пензенской губернии.

   В 1921 году наряду с действующей начальной кустовой школой создана Школа Крестьянской Молодежи (ШКМ) по приказу наркома образования губернии.

   В 1933 году начальная кустовая школа и ШКМ сливаются в Чернозерскую семилетнюю школу по приказу РОНО.

   В 1939 году семилетняя школа реорганизуется в среднюю школу на основании приказа областного отдела народного образования.

   В 1942 году школа вновь реорганизуется в семилетнюю по приказу РОНО.

   В 1951 году семилетняя школа реорганизуется в Чернозерскую среднюю общеобразовательную школу по приказу РОНО.

   Решением Малого Совета районного Совета народных депутатов №170 от 10.06.1993 года Чернозерская средняя общеобразовательная школа переименована в Чернозерскую муниципальную общеобразовательную школу.

   Распоряжением главы администрации Мокшанского района Пензенской области № 7 от 14.01.2002 года в Устав Чернозерской муниципальной средней общеобразовательной школы внесены изменения. Устав зарегистрирован инспекцией МНС России по Мокшанскому району Пензенской области 01.06.2002 года.

   Приказом УО Мокшанского района Пензенской области № 28 от 24.06.2004 года Чернозерская муниципальная средняя общеобразовательная школа переименована в муниципальное образовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу с. Чернозерье (МОУ СОШ с.Чернозерье). Устав зарегистрирован инспекцией МНС России по Мокшанскому району Пензенской области 20 июля 2004 года.

   Приказом УО администрации Мокшанского района № 40 от 27.03.2006 года муниципальное образовательное учреждение средняя общеобразовательная школа с.Чернозерье переименовано в муниципальное общеобразовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу с. Чернозерье.

   Приказом Управления образованием администрации Мокшанского района № 136 от 27.10.2011 г. Муниципальное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа с.Чернозерье переименовано в Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение среднюю общеобразовательную школу с.Чернозерье Мокшанского района Пензенской области.

   Приказом Управления образованием администрации Мокшанского района № 60 от  14.06.2017 г.  Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа с.Чернозерье Мокшанского района Пензенской области переименовано в Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение основную общеобразовательную школу с.Чернозерье  Мокшанского района Пензенской области.